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A denominada madeira petrificada é um fóssil dos mais conhecidos, que ocorre na Bahia em vários locais, destacando-se Macururé e Petrolândia.
Sua formação se dá especialmente pela substituição do Carbono presente na Celulose por Sílica. Daí, neste caso, é um processo de Substituição, o qual provoca uma Silicificação, gerando uma Pseudomorfose.
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É uma Pseudomorfose porque, apesar da forma preservada, ali não temos mais madeira.
A madeira petrificada é uma madeira que foi silicificada, um fóssil, na verdade, uma rocha que substitui completamente o antigo vegetal.
A Celulose é o componente estrutural da madeira, o que a torna o principal componente da estrutura de sustentação orgânica de uma ávore. Trata-se de um polissacarídeo de alto peso molecular que não é solúvel em água”.
A Sílica aparece como uma variedade hidratada de Óxido de Silício, ou seja, basicamente a mesma composição do Quartzo, acrescida de água.
No processo de silicificação que gera "pseudomorfoses", perde-se o material orgânico original, substituído por outro inorgânico. No caso em questão, o material esquelético original de ávores, no caso a madeira, é substituído por um novo mineral, no caso um mineral de Sílica.
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Também os espaços vazios acabam preenchidos por Sílica, que vem sob a forma de um silicato hidratado, como calcedônia ou opala. Assim, o material original, a celulose, não permanece.
A opala é uma variedade criptocristalina, ou seja, microscópica, de Quartzo, hidratada, ou seja, rica em água.

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Outro tipo de pseudomorfose é aquela em que antigas conchas se tornaram conchas fósseis piritizadas, isto é, seu antigo CaCO3 foi substituído por FeS2.
Exemplo de fossilização por Piritização:



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